Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PtprcP06800 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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PtprcP06800 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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PtprcP06800 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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PtprcP06800 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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PtprcP06800 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprcP06800 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprcP06800 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms