Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01783 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01783 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01783 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01783 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01783 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01783 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01783 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01783 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01783 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01783 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01783 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01783 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01783 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01783 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01783 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01783 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms