Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PomcP01193 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PomcP01193 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PomcP01193 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PomcP01193 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PomcP01193 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PomcP01193 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PomcP01193 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PomcP01193 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PomcP01193 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PomcP01193 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PomcP01193 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PomcP01193 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PomcP01193 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PomcP01193 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PomcP01193 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PomcP01193 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PomcP01193 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PomcP01193 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PomcP01193 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms