Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp2a2O55143 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms