Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl35aO55142 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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