Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sp100O35892 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sp100O35892 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp100O35892 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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