Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atf6bO35451 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms