Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kpna3O35344 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna3O35344 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms