Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkd2O35245 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkd2O35245 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms