Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltaO08585 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltaO08585 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltaO08585 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltaO08585 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltaO08585 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltaO08585 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltaO08585 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltaO08585 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltaO08585 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltaO08585 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltaO08585 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltaO08585 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltaO08585 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltaO08585 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltaO08585 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltaO08585 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltaO08585 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltaO08585 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltaO08585 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CltaO08585 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CltaO08585 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CltaO08585 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltaO08585 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms