Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm3488M0QW81 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gm3488M0QW81 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm3488M0QW81 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms