Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa3bJ9JI28 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa3bJ9JI28 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa3bJ9JI28 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwa3bJ9JI28 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vwa3bJ9JI28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vwa3bJ9JI28 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa3bJ9JI28 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa3bJ9JI28 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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