Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20877J3QPZ4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20877J3QPZ4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20877J3QPZ4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20877J3QPZ4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20877J3QPZ4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20877J3QPZ4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20877J3QPZ4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20877J3QPZ4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20877J3QPZ4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20877J3QPZ4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20877J3QPZ4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20877J3QPZ4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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