Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3099J3QPA5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms