Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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