Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms