Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms