Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r34G3XA52 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r34G3XA52 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms