Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp9yF8VPU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp9yF8VPU6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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