Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8127E9Q0P0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm8127E9Q0P0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8127E9Q0P0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8127E9Q0P0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8127E9Q0P0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8127E9Q0P0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm8127E9Q0P0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms