Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdr1E9Q0B4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms