Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sbf2E9PXF8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sbf2E9PXF8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms