Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prr29B1ARI9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms