Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtcflA2APF3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtcflA2APF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms