Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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