Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Csmd1Q923L3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms