Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
SrprbP47758 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms