Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccdc18Q640L5 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccdc18Q640L5 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccdc18Q640L5 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccdc18Q640L5 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccdc18Q640L5 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ccdc18Q640L5 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc18Q640L5 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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