Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC091683.2-201ENSMUST00000222996 1185 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Spag11a-201ENSMUST00000058955 436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr45-201ENSMUST00000084454 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Sytl4-201ENSMUST00000033608 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Pi4kb-203ENSMUST00000125476 3400 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Zfp473-201ENSMUST00000060270 3800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Cpa5-203ENSMUST00000115139 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm36670-202ENSMUST00000210400 1405 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm10364-201ENSMUST00000076633 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm14089-201ENSMUST00000130025 318 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm25145-201ENSMUST00000177640 110 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm27651-201ENSMUST00000183465 246 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Hoxd9P28357 CT030646.1-201ENSMUST00000225049 980 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 AC107711.5-201ENSMUST00000228149 594 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Ucn2-201ENSMUST00000052724 1155 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Eif4b-201ENSMUST00000169681 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Hoxd9P28357 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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