Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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