Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Irx1P81068 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Irx1P81068 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms