Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krt27Q9Z320 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms