Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb6Q9Z0T9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb6Q9Z0T9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms