Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms