Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MthfrQ9WU20 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MthfrQ9WU20 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms