Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrf1Q9WU00 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms