Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a3Q9QZS0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms