Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim44Q9QXA7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim44Q9QXA7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms