Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkl2Q9QUK0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms