Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cabp5Q9JLK3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp5Q9JLK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms