Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc5a3Q9JKZ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms