Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tuba8Q9JJZ2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Tuba8Q9JJZ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Tuba8Q9JJZ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Tuba8Q9JJZ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tuba8Q9JJZ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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