Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms