Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riox1Q9JJF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms