Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp29Q9ES63 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp29Q9ES63 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp29Q9ES63 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp29Q9ES63 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp29Q9ES63 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp29Q9ES63 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp29Q9ES63 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp29Q9ES63 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp29Q9ES63 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp29Q9ES63 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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