Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc4Q9ES56 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc4Q9ES56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms