Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ripk4Q9ERK0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms