Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rapgef4Q9EQZ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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