Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyp3a44Q9EQW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms