Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chst1Q9EQC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst1Q9EQC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms